Bibliometric Analysis on Methods and Tools Developed for DGE Analysis: Current Trends and Future Perspectives

Abstract

Diferansiyel gen ekspresyonu (DGE) analizi, yeni nesil dizileme teknolojilerinin ortaya çıkışıyla önemli bir ilgi kazanmıştır. Bu durum, DGE analizi için çeşitli yöntemlerin ve araçların geliştirilmesine yol açmıştır. Bu çalışmada, Biblioshiny ve VOSviewer yazılımları kullanılarak, incelenen dönem boyunca eğilimleri araştırmak amacıyla bibliyometrik analiz yapılmıştır. 2005-2023 yılları arasında Web of Science veri tabanından, diferansiyel gen ekspresyonu ile ilgili terimleri konu alan ilgili makaleler taranmıştır. İncelenen dönem boyunca yayımlanan eğilimleri göstermek için Biblioshiny ve VOSviewer yazılımları kullanılarak ağ haritaları oluşturulmuştur. Toplamda 729 çalışma, DGE analizi metodolojilerindeki, araçlarındaki ve paketlerindeki eğilimleri ortaya koymak amacıyla incelenmiştir. Bu amaçla, ülke, kurum, kaynak, yazar ve anahtar kelime üretkenliği açısından eş-yazarlık, bibliyografik eşleşme ve eş-oluşum analizleri yapılmıştır. 2005 yılından sonra çıktı ve atıf sayılarında artış gözlenmiştir. Çalışma süresince ABD ve Çin, DGE analizine en çok katkı sağlayan ülkeler olarak öne çıkmıştır. Zamansal çalışmalar, belirli aralıklarla bir miktar azalma olmakla birlikte, zaman içinde yayınlarda önemli bir artış olduğunu ortaya koymuştur. En büyük düşüş, 2008 ile 2010 yılları arasında gözlenmiştir. Bu düşüşlere rağmen, DGE analizi, herhangi bir hastalığın mekanizmalarını, gen işlevlerini ve terapötik hedefleri anlamadaki temel rolü nedeniyle genomikte kritik bir konu olmaya devam etmektedir. Bu eğilim, mevcut yöntemlerin ve araçların, çeşitli hastalıklarla ilişkili anahtar bilgilendirici genleri tanımlamak için yeterince güçlü kabul edildiğini göstermektedir.